通过#使用meson
通过利用通过 numpy.distutils 使用meson
中描述的技术获得的关键优势是,它可以轻松地输入到现有系统和更大的项目中。有一个相当Pythonic的语法,这使得它更舒适并且更适合用户扩展。meson
python
笔记
至少需要介子0.46.0
才能解析python
包含目录。
斐波那契演练 (F77) #
在C
使用像meson
.我们将通过以下方式获得它:
python -m numpy.f2py fib1.f -m fib2
现在,考虑以下meson.build
文件fib
以及三种包装方式 - 入门scalar
部分
的示例:
project('f2py_examples', 'c',
version : '0.1',
license: 'BSD-3',
meson_version: '>=0.64.0',
default_options : ['warning_level=2'],
)
add_languages('fortran')
py_mod = import('python')
py = py_mod.find_installation(pure: false)
py_dep = py.dependency()
incdir_numpy = run_command(py,
['-c', 'import os; os.chdir(".."); import numpy; print(numpy.get_include())'],
check : true
).stdout().strip()
incdir_f2py = run_command(py,
['-c', 'import os; os.chdir(".."); import numpy.f2py; print(numpy.f2py.get_include())'],
check : true
).stdout().strip()
inc_np = include_directories(incdir_numpy, incdir_f2py)
py.extension_module('fib2',
[
'fib1.f',
'fib2module.c', # note: this assumes f2py was manually run before!
],
incdir_f2py / 'fortranobject.c',
include_directories: inc_np,
dependencies : py_dep,
install : true
)
此时构建将完成,但导入将失败:
meson setup builddir
meson compile -C builddir
cd builddir
python -c 'import fib2'
Traceback (most recent call last):
File "<string>", line 1, in <module>
ImportError: fib2.cpython-39-x86_64-linux-gnu.so: undefined symbol: FIB_
# Check this isn't a false positive
nm -A fib2.cpython-39-x86_64-linux-gnu.so | grep FIB_
fib2.cpython-39-x86_64-linux-gnu.so: U FIB_
回想一下,原始示例(如下所示)位于 SCREAMCASE 中:
C FILE: FIB1.F
SUBROUTINE FIB(A,N)
C
C CALCULATE FIRST N FIBONACCI NUMBERS
C
INTEGER N
REAL*8 A(N)
DO I=1,N
IF (I.EQ.1) THEN
A(I) = 0.0D0
ELSEIF (I.EQ.2) THEN
A(I) = 1.0D0
ELSE
A(I) = A(I-1) + A(I-2)
ENDIF
ENDDO
END
C END FILE FIB1.F
使用标准方法,暴露给python
isfib
和 not 的子例程FIB
。这意味着我们有几个选择。一种方法(如果可能)是将原始 Fortran 文件小写,例如:
tr "[:upper:]" "[:lower:]" < fib1.f > fib1.f
python -m numpy.f2py fib1.f -m fib2
meson --wipe builddir
meson compile -C builddir
cd builddir
python -c 'import fib2'
然而,这需要能够修改源代码,而这并不总是可能的。解决这个问题最简单的方法就是让f2py
处理它:
python -m numpy.f2py fib1.f -m fib2 --lower
meson --wipe builddir
meson compile -C builddir
cd builddir
python -c 'import fib2'
自动生成包装器#
上述定义的工作流程中的一个主要痛点是手动跟踪输入。尽管出于F2PY 和 Build Systems中讨论的原因,需要付出更多努力来找出实际输出。
笔记
从 NumPy1.22.4
开始,f2py
将根据输入文件 Fortran 标准(F77 或更高版本)确定性地生成包装文件。
--skip-empty-wrappers
可以传递 来f2py
恢复之前仅在输入需要时生成包装器的行为。
但是,我们可以直接扩展我们的工作流程,以考虑在设置构建系统时已知输出的文件。
project('f2py_examples', 'c',
version : '0.1',
license: 'BSD-3',
meson_version: '>=0.64.0',
default_options : ['warning_level=2'],
)
add_languages('fortran')
py_mod = import('python')
py = py_mod.find_installation(pure: false)
py_dep = py.dependency()
incdir_numpy = run_command(py,
['-c', 'import os; os.chdir(".."); import numpy; print(numpy.get_include())'],
check : true
).stdout().strip()
incdir_f2py = run_command(py,
['-c', 'import os; os.chdir(".."); import numpy.f2py; print(numpy.f2py.get_include())'],
check : true
).stdout().strip()
fibby_source = custom_target('fibbymodule.c',
input : ['fib1.f'], # .f so no F90 wrappers
output : ['fibbymodule.c', 'fibby-f2pywrappers.f'],
command : [py, '-m', 'numpy.f2py', '@INPUT@', '-m', 'fibby', '--lower']
)
inc_np = include_directories(incdir_numpy, incdir_f2py)
py.extension_module('fibby',
['fib1.f', fibby_source],
incdir_f2py / 'fortranobject.c',
include_directories: inc_np,
dependencies : py_dep,
install : true
)
这可以像以前一样编译和运行。
rm -rf builddir
meson setup builddir
meson compile -C builddir
cd builddir
python -c "import numpy as np; import fibby; a = np.zeros(9); fibby.fib(a); print (a)"
# [ 0. 1. 1. 2. 3. 5. 8. 13. 21.]
要点#
值得记住以下几点:
meson
-fimplicit-none
默认情况下会默认通过gfortran
,这与标准np.distutils
行为不同在这种情况下不可能使用 SCREAMCASE,因此文件的内容
.f
或生成的包装器.c
需要降低为常规字母;这可以通过以下--lower
选项 来促进F2PY